Schulleiterin des Moll-Gymnasiums ist Dr. Gabriele Mark, stellvertretender Schulleiter Christof Höger.
Daneben bildet die erweiterte Schulleitung das Leitungsgremium der Schule. Diese besteht im Allgemeinen aus der Schulleiterin, deren Stellvertreter sowie den Abteilungsleitungen und ist u.a. für die Planung der Unterrichtsorganisation, Fragen der Schulentwicklung, Beratung der Schüler:innen und Leitung der Fachabteilungen zuständig.